油水分離器在運行的時候，有兩方面是需要重點關注的，分別是它的液位和壓力。為了保證油水分離器的功效能夠得到徹底的發揮，不管是液位還是壓力都需要有所控制，控制的具體方式如下：

油水分離器中除了油和水之外，剩下的就是各種雜質了，它的液面可以由控制器控制的出油閥進行調節。這機構中包括了液位傳感器、控制器、浮子液面調節器等，從而準確的控制油水分離器的液面。
設備中壓力的控制會相對復雜一些，油水分離器可以有效的將原油中的部分水分離出來，當混合物進入設備中之后，自由水會沉降至底部形成水層，其上是原油和含有較小水滴的乳狀油層。原油和乳狀油從擋板上面溢出，而所需的壓力也是由閥門控制。